Rete e Pubblicazioni
Contattaci per opportunità di partnership#condivisione #visione #passione #innovazione
I nostri partner
IGATech: Applicare la Genomica
Abbiamo stabilito numerose collaborazioni con centri di eccellenza in tutto il mondo e messo a disposizione di numerosi ricercatori e aziende le nostre attrezzature, competenze e conoscenze per soluzioni innovative.
Pubblicazioni
Genoma di Riferimento del Grano Duro cv. Svevo Rel. 2.0: Uno Strumento Completo per la Genomica del Grano
Il risequenziamento approfondito rivela nuovi SNP, InDel e varianti strutturali di grandi dimensioni per l'impronta clonale dell'arancio dolce [Citrus sinensis (L.) Osbeck]
Un approccio di sequenziamento duplex per il rilevamento ad alta sensibilità di piante geneticamente modificate
Un assemblaggio a livello cromosomico rivela aberrazioni cromosomiche e scambi che generano diversità genetica nel germoplasma di Coffea arabica
Mappatura dei tratti di gusto e sapore rispetto ai marcatori genetici nella lattuga Lactuca sativa.
Accessioni di Coffea mozambicane delle isole di Ibo e Quirimba: identificazione e distribuzione geografica
Sviluppo e applicazione del saggio SNP con tecnologia Single Primer Enrichment Technology (SPET) per l'analisi di genomica delle popolazioni e l'identificazione di geni candidati nella lattuga
Valutazione del DNA vegetale residuo nel latte di massa per la produzione del Grana Padano DOP mediante un approccio di metabarcoding
Dissezione genetica della data di maturazione del frutto nell'albicocco (P. armeniaca L.) attraverso un approccio di Single Primer Enrichment Technology (SPET)
Un singolo evento di poliploidizzazione all'origine del genoma tetraploide di Coffea arabica è responsabile dell'estrema bassa variazione genetica nel germoplasma selvatico e coltivato
Mappatura Genetica del Locus di Incompatibilità nell'Olivo e Sviluppo di un Marcatore Sequence-Tagged Site Collegato
Una sequenza del genoma di melanzana ancorata ai cromosomi rivela eventi chiave nell'evoluzione delle Solanacee
Tecnologia a Singolo Primer di Arricchimento (SPET) per la Genotipizzazione ad Alto Rendimento in Pomodoro e Melanzana
La tecnologia di arricchimento a singolo primer come strumento per la genotipizzazione massiva: un confronto su pioppo nero e mais
Un approccio multiscala per rilevare la selezione in specie arboree non modello: adattamento diffuso nonostante il declino della popolazione in Taxus baccata L
L'accumulo delle risposte allo stress osmotico all'interno dell'apice radicale in crescita mediante cinematica e sequenziamento dell'RNA.
Il Genoma del Kiwi
Una mappa di consenso ad alta densità basata su SNP del grano tetraploide come ponte per integrare la genomica e il miglioramento genetico del grano duro e del grano tenero
Proprietà genetiche della popolazione MAGIC del mais: una nuova piattaforma per la mappatura QTL ad alta definizione in Zea mays
Il metabarcoding rivela un batterio potenzialmente non descritto che causa la colonnarite in una malattia cutanea peracuta della trota iridea (Oncorhynchus mykiss, Walbaum)
Nuove conoscenze sulle dinamiche del microbioma durante un focolaio di malattia branchiale nella trota iridea (Oncorhynchus mykiss) allevata
Il DNA ambientale come strumento per la valutazione preliminare della biodiversità dei vertebrati: un caso di studio sugli ecosistemi di acqua dolce siciliani
DNA ambientale: una caratterizzazione preliminare della biodiversità degli invertebrati in un fiume siciliano
L'uso del DNA ambientale: caratterizzazione preliminare del microbiota in tre laghi siciliani
Perturbazioni nelle comunità microbiche presso le sorgenti idrotermali dell'Isola di Panarea (Isole Eolie, Italia)
DNA ambientale: caratterizzazione preliminare del microbiota in tre laghi siciliani
DNA ambientale: la prima istantanea della biodiversità dei vertebrati in tre laghi siciliani
Il tuo copre me? Effetto della riduzione della copertura sugli studi di sequenziamento shotgun del metagenoma
Il sequenziamento ddRAD-seq rivela la struttura genetica e individua segnali di selezione nella trota fario italiana
Assemblathon 2: valutazione dei metodi de novo di assemblaggio del genoma in tre specie di vertebrati
Le interazioni sinergiche tra parassiti e patogeni mediate dall'immunità dell'ospite possono causare il collasso delle colonie di api.
Sequenza del genoma in bozza del lievito probiotico Kluyveromyces marxianus fragilis B0399.
La chemiodiversità alcaloidea nelle specie di Mandragora è associata alla perdita di funzionalità di MoH6H, un gene della ioscamina 6β-idrossilasi
Strumenti genomici per il miglioramento genetico del grano duro: assemblaggio de novo del trascrittoma di Svevo e identificazione di SNP nel germoplasma elite
Resistenza alla Sharka nell'albicocco: confronto tra gli aplotipi resistenti e suscettibili ricostruiti in fase del cromosoma 1 di 'Lito' e analisi dei geni candidati
Un genoma annotato manualmente di Actinidia chinensis var. chinensis (kiwi) evidenzia le sfide associate ai genomi in bozza e alla predizione genica nelle piante
Geni e cluster genici correlati al genotipo e alla variazione indotta dalla siccità nel potenziale di saccarificazione, nel contenuto di lignina e nei tratti anatomici del legno in Populus nigra
Mappa fisica del braccio corto del cromosoma 3D del grano tenero
Il genoma bozza di alta qualità del pesco (Prunus persica) identifica modelli unici di diversità genetica, domesticazione ed evoluzione del genoma.
Sequenza genomica in bozza di Lactobacillus rossiae DSM 15814(T).
Proteine leganti gli odoranti e codifica olfattiva nell'ape solitaria Osmia cornuta.
Una mappa di associazione basata su RAD di kiwi (Actinidia chinensis Pl.) come strumento per migliorare l'assemblaggio del genoma e per scansionare la regione genomica del determinante del genere per il miglioramento genetico assistito da marcatori
La mappa fisica del cromosoma 5DS del frumento ha rivelato duplicazioni geniche e piccoli riarrangiamenti
Una base di conoscenza per l'analisi funzionale di Vitis vinifera
Mappatura fisica del cromosoma 5A del grano tenero: un approccio integrato
Identificazione degli mRNA correlati alla tumorigenesi associati alla proteina legante l'RNA HuR nelle cellule del cancro della tiroide Oncotarget.
Cattura dell'Esoma con Arricchimento Eterologo nel Suino (Sus scrofa) PLoS One.
Associazione suggestiva dell'epilessia familiare del lobo temporale mesiale al cromosoma 3q26
Mutazioni eterozigoti di reelin causano epilessia temporale laterale autosomica dominante
I limiti e il potenziale delle tecniche paleogenomiche per la ricostruzione della domesticazione della vite
Variazioni del numero di copie (CNV) e variazioni strutturali nelle piante: prospettive degli approcci NGS
Identificazione, Ricostruzione e Validazione di Inserzioni nei Progetti di Risequenziamento con GapFiller
GAM: Genomic Assemblies Merger
Dinamiche dei retrotrasposoni LTR nell'evoluzione del genoma dell'olivo (Olea europaea).
Rilevamento su larga scala di varianti rare mediante sequenziamento next-generation multiplexed in pool: verso l'Ecotilling di nuova generazione
Il sequenziamento di diversi genomi di mandarino, pummelo e arancia rivela una complessa storia di ibridazione durante la domesticazione degli agrumi.
Il paesaggio peculiare delle sequenze ripetitive nel genoma dell'olivo (Olea europaea L.).
Una mutazione unica in un gene MYB cosegrega con il fenotipo nettarina nella pesca.
I florendovirus endogeni sono componenti principali dei genomi vegetali e caratteristiche distintive dell'evoluzione virale
Prime informazioni sul trascrittoma e sviluppo di nuovi strumenti genomici di una specie arborea circum-mediterranea diffusa, Pinus halepensis Mill
Dinamiche dei retrotrasposoni LTR nell'evoluzione del genoma dell'olivo (Olea europaea)
Una valutazione approfondita degli effetti del trimming delle read sull'analisi dei dati NGS Illumina.
GAM-NGS: fusione di assemblaggi genomici per il sequenziamento di nuova generazione.
L'APE1 dei mammiferi controlla il processing dei miRNA e il suo interattoma è collegato al metabolismo dell'RNA nel cancro
Mutazioni de novo in SLC25A24 causano un disturbo caratterizzato da invecchiamento precoce, displasia ossea, viso caratteristico e morte precoce
Rigenerazione dell'intera epidermide umana utilizzando cellule staminali transgeniche
Caratterizzazione delle proteine S-layer della coltura starter probiotica potenziale Lactobacillus brevis SF9B isolata dai crauti
Il gruppo genetico Guiana del cacao (Theobroma cacao L.): una nuova collezione centrale nella Guyana francese
Una nuova versione dell'assemblaggio del genoma di riferimento della vite (12X.v2) e della sua annotazione (VCost.v3)
Assemblaggio de novo, annotazione funzionale e analisi del trascrittoma fogliare della canna comune (Arundo donax L.) forniscono strumenti per lo sviluppo di una materia prima per biocarburanti
Riduzione dell'eterozigosità (ROH) come metodo per rilevare la variazione strutturale a mosaico
Caratterizzazione del pan-genoma del pioppo mediante identificazione su scala genomica delle variazioni strutturali
Nuove risorse per gli studi genetici in Populus nigra: scoperta di SNP a livello dell'intero genoma e sviluppo di un array Infinium da 12k
Impatto di un fungo micorrizico arbuscolare rispetto a un inoculo microbico misto sulla riprogrammazione del trascrittoma delle radici di vite
Diversità molecolare e genomica del paesaggio del parente selvatico delle colture Triticum urartu nella Mezzaluna Fertile
Variazione genotipica e tessuto-specifica dei profili trascrittomici di Populus nigra in risposta alla siccità
Spostare i limiti nella ricerca e nel miglioramento genetico del grano utilizzando un genoma di riferimento completamente annotato
Il microbiota degli ectoparassiti ematofagi raccolti da uccelli migratori
Profili metagenomici di diversi tipi di Mozzarella italiana ad alta umidità
Variazioni strutturali che interessano geni ed elementi trasponibili del cromosoma 3B nei frumenti
La diversità genomica a livello globale e i pattern di migrazione nei dromedari seguono le antiche rotte carovaniere
Rilevanza evolutiva dei lignaggi nel pino nero europeo (Pinus nigra) nell'era trascrittomica
La capacità funzionale di Lactobacillus plantarum SF9C, produttore di plantaricina, e Lactobacillus brevis SF9B, dotato di S-layer, di resistere al transito gastrointestinale
Il contenuto di miRNA degli esosomi rilasciati dal microambiente del glioma può influenzare la progressione maligna
Analisi della Rete Genica a Singola Cellula e Panorama Trascrizionale delle Linee Cellulari di Neuroblastoma con Amplificazione di MYCN
Sindrome di Lynch e fenotipo di Muir-Torre associati a una variante ricorrente nella regione 3'UTR del gene MSH6
Una firma di NF-κB predice la prognosi del glioma di basso grado: un approccio di medicina di precisione basato su cellule staminali derivate dal paziente
Associazioni differenziali tra polimorfismi nucleotidici e tratti fisiologici in piante di abete rosso (Picea abies Karst.) sotto regimi idrici contrastanti
Il trascrittoma di SH-SY5Y a risoluzione a singola cellula: un flusso di lavoro di analisi dei dati CITE-Seq
I genomi di 204 accessioni di Vitis vinifera rivelano l'origine delle uve da vino europee
Valutazione della sensibilità e della specificità nel rilevamento di patogeni virali della vite mediante RNA-Seq
Prima rilevazione in Italia di un focolaio di SARS-CoV-2 variante Alpha – lineage B.1.1.7 trasmesso da uomo a gatto
Il sequenziamento ddRAD-seq rivela la struttura genetica e individua segnali di selezione nella trota fario italiana
Fitness di crescita, assorbimento dell'eme e varianti genomiche in mutanti di ceppi tolleranti all'ossigeno di Lacticaseibacillus casei e Lactiplantibacillus plantarum























